Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms