Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms