Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms