Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb4Q02738 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms