Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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