Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms