Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms