Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja5Q01231 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms