Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms