Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms