Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms