Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms