Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms