Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms