Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VldlrP98156 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VldlrP98156 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VldlrP98156 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms