Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms