Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec1P97353 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec1P97353 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec1P97353 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms