Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms