Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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