Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms