Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194 ms