Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms