Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms