Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb13P70321 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms