Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp3P70281 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms