Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms