Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms