Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba4aP68368 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tuba4aP68368 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tuba4aP68368 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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