Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms