Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms