Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms