Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms