Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PlnP61014 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PlnP61014 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PlnP61014 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms