Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms