Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms