Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp4P59240 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp4P59240 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp4P59240 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp4P59240 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp4P59240 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms