Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms