Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms