Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms