Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf2P58021 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms