Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms