Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1P56716 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms