Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TdgP56581 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TdgP56581 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TdgP56581 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TdgP56581 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms