Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GferP56213 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GferP56213 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GferP56213 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms