Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Map3k1P53349 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms