Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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