Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1cP52432 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1cP52432 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1cP52432 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms