Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms