Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms