Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6aP50446 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms